Uma excelente virada a todos e um 2012 daquió!

[o presentinho abaixo foi roubado do Viver a Ciência]

O esquema abaixo, apresentado por Hessel em sua conferência, mostra uma possível equivalência entre a hierarquia observada na engenharia computacional e uma para a biologia sintética. E resume bem a ideia de manipulações moleculares, que interferem no metabolismo celular, a partir de intervenções diretas no “código-fonte” da vida, o DNA.

Andrianantoandro, E.; Basu S.; Karig D.K.; Weir R. Synthetic biology: new engineering rules for an emerging discipline. Molecular Systems Biology, 2, 2006. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16738572

A partir do uso de “peças Lego da biologia sintética”, disponíveis em bancos como o da Do-It-Yourself Biologist e da BioBricks Foundation, novas estruturas celulares e mesmo organismos inteiros podem ser sintetizados. De acordo com Hessel, tudo que hoje é feito quimicamente, como combustível, plástico e fertilizantes, poderá ser feito bioquimicamente.

E muito já se tem feito. O próprio Hessel, por exemplo, esta à frente de uma cooperativa open source com objetivo de mudar o paradigma biotecnológico do tratamento do câncer por meio da biologia sintética (Pinky Army Cooperative). Outra iniciativa interessante é a competição em biologia sintética voltada a estudantes (International Genetically Engineered Machine Competition – iGEM), patrocinada por importantes instituições de desenvolvimento científico e tecnológico, como o MIT, a Nasa, a National Science Foundation e a Biobricks Foundation.

Um grupo de estudantes da USP, candidato à próxima versão da competição iGEM, vem escrevendo um blog que se converteu rapidamente em uma excelente fonte sobre biologia sintética em língua portuguesa. Com informação qualificada e acessível para não especialistas, o SynbioBrasil é um ótimo ponto de partida para conhecer o básico sobre biologia sintética e se manter atualizado a respeito dos avanços da área.

Este infográfico elaborado pela revista Seed Magazine também é um bom ponto de partida, assim como o vídeo abaixo, realizado pela Universidade de Bristol.

Frente ao magnífico avanço dessa nova vertente da biotecnologia, o que ainda esta incipiente é o debate ético e o relacionado à biossegurança, como bem colocou Paul Roote Wolpe na Ted Talk que já virou post aqui no blog. O recém criado Virtual Biossecurity Center é uma importante iniciativa no sentido de estabelecer uma rede entre cientistas, educadores e governantes que podem colaborar para o desenvolvimento de uma “biotecnologia responsável”. Quanto a isso, assino embaixo da frase de Hessel no encerramento de sua conferência: Training young people is the best security system.

Filed under: biologia sintética, genética Tagged: bioética, biologia sintética, biossegurança, biotecnologia, divulgação científica, engenharia genética, ensino de ciências ]]> http://ciencianamidia.wordpress.com/2011/12/05/mais-biologia-sintetica/feed/ 7 Tati Nahas synthetic_biology http://ciencianamidia.wordpress.com/2011/12/04/de-biologia-e-tecnologia/ http://ciencianamidia.wordpress.com/2011/12/04/de-biologia-e-tecnologia/#comments Sun, 04 Dec 2011 11:16:38 +0000 trnahas http://ciencianamidia.wordpress.com/?p=5938 ]]> Como prometido, segue a íntegra da minha coluna escrita para a segunda edição da Revista Quanta.

Dessa vez, falo um pouco sobre biologia sintética, inspirada pelo evento satélite do VII Congresso Brasileiro de Biossegurança, organizado pela Anbio. Fiquei encantada pela área, especialmente cativada pela excelente conferência de abertura proferida por Andrew Hessel, da Singularity University. No próximo post amplio um pouco o papo sobre o tema e indico alguns ótimos links para quem quiser conhecer um pouco mais sobre a área.

Por enquanto, seguem os links para os estudos mencionados na coluna:

• Ciência, Tecnologia e Inovação na Mídia Brasileira – Andi e Fundep, 2009;
• Desenvolvimento de comunicação estratégica sobre biossegurança de plantas geneticamente modificadas – o caso do projeto LAC – Biosafety no Brasil – Embrapa Meio Ambiente, 2011.

A nova edição da Revista Quanta ja esta nas bancas! A reportagem de capa esta bem bacana, trazendo um amplo apanhado sobre as principais questões químicas, geopolíticas, biológicas etc relacionadas ao lítio.

Também gostei muito da entrevista com Verônica Valentinuzzi, cronobióloga de primeira com quem tive o prazer de trabalhar durante a pós-graduação. A íntegra da entrevista pode ser lida aqui: Cronobiologia – os ritmos da vida.

Abaixo segue o índice com a descrição dos temas contemplados na edição e, no próximo post, a íntegra da minha coluna, que aborda a biologia sintética.

Estava pensando em tirar a poeira do blog e escrever um pouco sobre educação motivada pela celebração do dia do professor quando recebo de um querido professor a reflexão que reproduzo abaixo (com a devida autorização).

O texto é do professor José Roberto Castilho Piqueira, atual vice-diretor da Poli-USP, diretor-presidente da Sociedade Brasileira de Automática e de quem já falei um pouco por aqui. Espero que gostem e aproveito para deixar meu carinhoso abraço a todos os magníficos professores com quem tive a oportunidade de aprender muito e querer aprender sempre mais.

Professores: sofredores e educadores? – por José Roberto Castilho Piqueira

Abro meu correio eletrônico e encontro a gentil mensagem de um velho amigo: parabéns professores, sofridos educadores, pelo seu dia. Fico feliz, mas como todo professor começo refletir sobre o escrito. Será que minha profissão é sofrida? Depois de quarenta anos de sala de aula, giz e lousa, sou educador?

Desde pequeno, ver minha mãe ensinar me fascina. Do alto de seus 93 anos, Dona Elisa ainda mostra seus fortes traços de liderança e capacidade de aprender o novo, de maneira positiva e crítica, sem qualquer traço de sofrimento originário de sua profissão. Vê-la preparar suas aulas e seus antigos flanelógrafos era quase uma magia. Até hoje, quando escrevo na lousa ou faço uma apresentação eletrônica, lembro de seu capricho e perfeccionismo.

Talvez venha daí minha constante ansiedade por dar uma boa aula. A primeira vez que fiz isso a sério foi quando estava no terceiro ano de engenharia. Um colega que tinha um curso pré-vestibular me convidou e lá fui eu, dar aulas de Física.

De lá para cá, nunca mais parei. Trabalhei na indústria, em projetos e serviços de engenharia, mas o ensino sempre foi meu maior prazer. Não sou capaz de lembrar um momento de sofrimento, originário desse trabalho. Lembro dos cursos que lecionei, das disciplinas que aprendi e, principalmente, dos amigos que fiz nessa faina.

Sou capaz de entender que, ao longo do tempo, fui um privilegiado, vivendo sempre em instituições que respeitaram meu trabalho e de meus colegas, recebendo, sempre, remuneração compatível com o esforço. Talvez esteja aí a solução para eliminar os professores sofredores: bom ambiente de trabalho, respeito e remuneração digna. Estado e mantenedores de escolas particulares poderiam retomar essa receita. Ela é simples e custa muito menos do que parece.

Falando agora de educação, não gosto de receber o qualificativo de educador, pois não tenho preparo adequado para isso. Acredito que a tarefa de educar é muito pesada para ser deixada para o professor, exclusivamente. O professor é parte do processo, mas há a família, os pais, o Estado e a sociedade civil, responsáveis por exemplos de conduta, essenciais para uma educação que privilegie o ser humano e a vida no planeta.

Não dá para um simples professor, com algumas horas divididas entre certo número de alunos, competir com a televisão ou com a internet na tentativa de transmissão de valores sociais. Será que é possível, sem ajuda da família ou do Estado, mostrar quão vazios de valores reais são os reality-shows? Ou como as profissões que requerem estudo e trabalho são tão ou mais prazerosas e rentáveis que às relacionadas ao glamour?

Por essas e por outras, querido amigo, não sou sofrido e não quero ser educador. Sou só um professor de engenharia, que espera um futuro melhor para o país, com ensino público de qualidade, com alunos e professores felizes.

Enquanto esse dia não chega, sigo meu trabalho.

Atualização em 26/10/2011: O texto do Prof. Piqueira saiu aqui e, em seguida, o Globo o colocou no lugar da coluna do Veríssimo em 23/10/11 com o título Será que é possível?

Transcrevo a seguir a íntegra do texto publicado e ao final há uma reprodução do original como saiu na revista (clique na imagem para vê-la em tamanho maior).

Foi um grande desafio tentar discutir uma ideia no espaço da coluna e ainda vou precisar de mais algumas edições pra pegar melhor o jeitão do texto. Até lá – e sempre – conto com os comentários, sugestões e até puxões de orelha de vocês!

Com a palavra, o cientista – histórias da ciência narradas por seus protagonistas

A criação das primeiras revistas científicas nos idos dos anos 1660 – a inglesa Philosophical Transactions of the Royal Society e a francesa Journal des savants – substituiu a tradição oral da comunicação da ciência pelo registro escrito. Não eliminou, porém, a estrutura de contação de histórias para cientistas e outros leitores interessados sobre os últimos achados científicos. Esta mudança ocorreu no final do século 19, com a profissionalização da atividade científica.

Artigos revisados por pares segue sendo a principal forma de comunicação da ciência por cientistas. O que se deixou de lado foi parte do público-alvo original. Não seria bom se o cientista voltasse a contar suas histórias para todos os interessados? É o que defende um documento da American Academy of Arts and Sciences (AAAS).

A publicação da AAAS constatou que a postura do cientista tem sido de reforçar o coro que clama pela necessidade de letramento científico da população. O ponto de partida foi a observação de uma pesquisa de percepção pública de ciência de que a população tem uma visão positiva sobre a comunidade científica, mas esta tende a considerar o público ignorante e a mídia irresponsável.

Como a premissa que orienta as ações de políticas públicas vem sendo a do analfabetismo científico, estas têm se centrado no ensino da ciência na escola básica e na divulgação desta pela grande mídia. Ao se dirigir também aos cientistas, a pesquisa identificou outra frente de trabalho. O documento da AAAS, então, orienta o cientista para um papel mais ativo nesse processo, alertando-o sobre a importância de se reaproximar da população.

Tal postura encontra eco em outros chamados. Um exemplo é o editorial da britânica Nature instigando os cientistas a usarem blogs como ferramenta para divulgação de seu trabalho e interação com o público leigo .

Esta tarefa que se propõe ao cientista não é excludente da mais ampla. Sobretudo nos países em que a necessidade de alfabetização científica (e geral) ainda é premente. O que se defende é uma mudança de postura do cientista: mais que esperar por uma população letrada capaz de apoiar a ciência, tornar-se um narrador de si mesmo, contando o que faz.

Na final disto esta a possibilidade de ampliar a confiança e a parceria entre dois grupos interdependentes. Não lhe parece que o uso da cátedra de professor-doutor também como cadeira de contador de histórias traz, de fato, a ciência para o cotidiano de todos?

Acaba de ser lançada a Quanta, uma revista de divulgação das ciências naturais e reflexão sobre seu ensino.

O nascimento em pleno Ano Internacional da Química foi celebrado com a bela capa que chama para a matéria sobre as mudanças na Tabela Periódica. Abaixo, uma palhinha sobre o que mais recheia esta primeira edição.[clique nas imagens para vê-las ampliadas]

E no próximo post, a íntegra da minha coluna para a revista.

Após defender a ideia de que estamos vivendo a era da terceira evolução, ou evolução projetada (evolution by design), Paul traça uma retrospectiva dos recentes estudos em bioengenharia e biologia sintética. Já no final, um pouco dos mitos tradicionais: passa pela capa da The Economist que divulgou o genoma sintético de Craig Venter como se fosse criação da vida pelo homem e arremata com a clássica comparação com o laboratório de Frankestein.

A palestra foi proferida em novembro de 2010, então agora Paul já teria mais um dado a adicionar à sua linha do tempo da terceira evolução, afinal ontem foi anunciada a primeira célula eucariótica com um par de cromossomos sintéticos. A pergunta que lança ao final segue válida e cada vez mais urgente: projetar organismos já é realidade, não é mais ficção científica; já não era hora de debatermos a sério a ética e a regulamentação desses procedimentos?

via @SymbioBrasil.

De todos os vários audiovisuais com que já me deparei por aí ilustrando o fato, esse é, sem dúvida, o mais bem humorado. Simples, direto e transmite uma boa ideia do que acontece em nossas células quando invadidas por esses seres que nem ao certo sabemos ainda se podemos chamar de vivos. Boa diversão!

O matemático Daniel Bernouilli é especialmente conhecido por seu trabalho com mecânica dos fluidos. Mas além de pioneiro da disciplina Física-Matemática, Bernouilli também é responsável por introduzir a matemática na análise de problemas na área biomédica quando, em 1760, usou um modelo matemático para estudar a dinâmica populacional da varíola.

Inspirados pelo sonho de Bernouilli de usar a modelagem matemática como agente colaborador na melhoria da saúde pública, José Roberto Castilho Piqueira e eu elaboramos um breve ensaio sobre o uso da Matemática na Biologia. Partimos do trabalho inicial de Bernouilli e analisamos como vem se desenrolando o casamento entre as duas disciplinas desde então, chegando na matemática biológica do século XXI e revisando as principais aplicações dos modelos matemáticos dinâmicos na pesquisa biológica e biomédica.

Convido-os para este passeio a ser iniciado com um clique!

P.S.: O link dá acesso à íntegra do artigo recém publicado na Revista do Instituto de Estudos Avançados da Universidade de São Paulo, mas em versão escaneada manualmente. Em breve esta nova edição da revista estará disponível na base Scielo, como as anteriores, e então substituirei pelo pdf de lá com melhor visualização. Atualização em 27/08/2011: link substituído.

Para saber mais (além das referências indicadas no artigo):

• Marring Math and Biology
• Connections between Mathematics and Biology
• What is Mathematical Biology
• Why is mathematical Biology so hard?
• A course in Mathematical Biology: quantitative modeling with mathematical and computational

Filed under: divulgação científica, experiências, história da ciência, matemática Tagged: biologia, Daniel Bernouilli, matemática, matemática biológica, pesquisa biológica, pesquisa biomédica, sistemas complexos, sistemas dinâmicos ]]> http://ciencianamidia.wordpress.com/2011/08/17/o-sonho-de-bernouilli/feed/ 1 Tati Nahas math_bio